原标题：R语言学习笔记之热图怎麼绘制热图

taoyan：R语言中文社区特约作家伪码农，R语言爱好者爱开源。

ComplexHeatmap包是bioconductor包用于怎么绘制热图复杂热图，它提供了一个灵活的解决方案来安排和注释多个热图它还允许可视化来自不同来源的不同数据之间的关联热图。可通过以下代码安装：

col：颜色向量（离散色彩映射）或颜色映射函数（如果矩阵是连续数）

注意行标题的默认位置是“left”，列标题的默认是“top”可以使用以下选项更改：

row_title_gp：用于怎么绘淛热图行文本的图形参数；

在上面的R代码中，fontface的可能值可以是整数或字符串：1 = plain2 = bold，3 =斜体4 =粗体斜体。如果是字符串则有效值为：

默认情況下，行和列是包含在聚类里的可以使用参数修改：

如果要更改列集群的高度或宽度，可以使用选项column_dend_height

不同的聚类距离计算方式

#也可以自萣义距离计算方式

请注意在上面的R代码中，通常为指定行聚类的度量的参数 clustering_distance_rows显示示例建议对参数clustering_distance_columns（列聚类的度量标准）使用相同的度量标准。

有很多方法来拆分热图一个解决方案是应用k-means使用参数km。

在执行k-means时使用set.seed()函数很重要这样可以在稍后精确地再现结果

#split也可以是一個数据框，其中不同级别的组合拆分热图的行

还可以将用户定义的树形图和分割相结合。在这种情况下split可以指定为单个数字：

name：热图標注的名称

col：映射到df中列的颜色列表

#注释名称可以使用下面的R代码添加

#要在左侧添加注释名称，请使用以下代码

可以使用选项width = unit（3“cm”））来控制热图大小。注意当组合多个热图时，第一个热图被视为主热图剩余热图的一些设置根据主热图的设置自动调整。这些设置包括：删除行集群和标题以及添加拆分等。

在基因表达数据中行代表基因，列是样品值关于基因的更多信息可以在表达热图之后附加，例如基因长度和基因类型

也可以可视化基因组变化和整合不同的分子水平（基因表达，DNA甲基化…）

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