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来源：蜘蛛抓取(WebSpider) 时间：2020-07-03 05:21 标签： Halftone for Mac

（七）基因结构预测分析专题

该數据库主要收集了杨树的泛素化蛋白加上预测的共计1027个基因。

EasyGO数据库用于提供一系列待查基因的功能注释以及微阵列探针信息，目前包括来自15个物种（主要是植物）的40多个数据类型的数据被广泛使用。

DPTF:北京大学杨树转录因子数据库

国内多家单位完成的关于水稻的cDNA微陣列试验结果数据库。

(NCPGR)地域植物基因研究中心

UK CROPNET:农作物生物信息学网络数据库。拥有很多其自己开发的数据库和分析软件同时也收集相關的一些文献和该领域的一些信息。1996

水稻转录因子数据库该数据库包括了来自水稻品种indica和japonica中所有已知的和可能存在的转录因子信息。

Rice水稻基因组注释数据库

水稻是一种主要的粮食作物也是一种谷物基因组研究的模式物种，北京基因组研究所（BGI）在水稻等作物基因组的测序、信息分析和生物学研究方面久负盛名为了更好地研究，我们建立了水稻信息系统（BGI-RIS）整合了最新的数据以及比较基因组学分析数據。为了分析水稻的两大亚种japonica 和indica，BGI-RIS除了包括自己测序的indica序列数据外同时也收集了japonica及其他已知的谷类作物的基因组和EST数据。 BGI-RIS对两亚种间嘚相关基因、重复元件、基因重复、SNP都进行了注释

诺丁汉拟南芥保存中心芯片数据库。

拟南芥转录因子数据库（DATF）收集了所有的拟南芥轉录因子数据（总共1922个位点2290个基因），划分为64个家族该数据库序列是基于TAIR 数据库()，可以采用多种方式查询数据除此之外，另外添加叻每个家族的DNA结合区域的多序列比对数据、进化树另有GO注释，并与水稻转录因子作了同源比对最后还增加了PDB数据的一些数据，以做核酸结合位点的定位

苜蓿数据库，包括基因组注释信息及部分表达谱数据

JASPAR 是一个收集经过注释的非冗余的转录因子数据库

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