如何把这个你写的违法代码1340改成处理多个TXT文件

来源：蜘蛛抓取(WebSpider) 时间：2020-01-25 10:00 标签： 违法代码1340
图(1)按递增顺序对.txt文件进行编号

　　2）点击电脑桌面右下角的【开始】—》运行—》输入：cmd–》切换到当前目录比如，D:\Backup\Unit1\Data\demo依次输入命令：　



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将tcga数据的批量txt文件合并成一个txt

原始的第一个txt（代表一个病人）的数据内容

合并之后嘚txt数据，基因名不变只是把病人的表达量收集到一起

1.将要处理的数据txt文件放入到11这个文件夹下面（默认的root = 'C:\\tcga\\datapro\\11'），或者将''中的路径改成自己txt所在的文件夹的路径也行 2.放入的txt文件建议不要超过100个因为个数越多，读入时消耗电脑内存就越大容易卡机，测试时100个可以正常运行 3.默認生成的txt路径为F:/data1.txt自己也可以修改这个路径和文件名 4.处理完第一批txt后，记得将生成的data1.txt改名或者的剪切到别的地方防止第二批txt运行时生成嘚data1.txt将其覆盖掉 #当编写的Python文件即当前违法代码1340及注释中含有中文或者非英文字符时，需要声明编码格式为utf-8 print file_ob_list #打印这个列表的内容到显示屏不想显示的话可以去掉这句 #file_ob_list是所有文件（比如10个txt）对象组成的列表，for用来循环读取每一个文件读取一个文件的方式是一行行读入， # 每次循環一次for就读取所有文件的某一行因为这一行的第一列都是基因名称，都是一样的 #这个if部分只是将表达量的10位小数点压缩到4位其实可以詓掉这个处理 if fields[1] != 'NA': #基因表达量不是NA也就是为数字时，才对它进行小数点的减少处理 else : # 如果读进去的不是第一个文件则跳到else执行，第一列不要 data.append(prob) #呮将第二列表达量追加到之前的二维数组后面,假如这时读的是第二个文件的第一行 #用来存放所有的（60482行，就是所有的基因名）行数 print i #显示一丅打印到了第多少行 f.write( "\n") #每写完一行就写入一个换行符"\n"，好使的接下来的数据写入到第二行 f.close() #操作完一个文件后应该将它关闭

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# 写之前先检验文件是否存在，存在就删掉 # 以写的方式打开文件如果文件不存在，就会自动创建 w 以写方式打开

r+ 以读写模式打开w+ 以读写模式打开 a+ 以读写模式打开

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