orbitrap属于什么类型的分析器的组成部分

LTQ-Orbitrap Velos 双分压线性阱和静电场轨道阱组匼式高分辨质谱性能及应用

上一期中我们简单介绍了Orbitrap Exploris? 480的设計原则和硬件性能在这期的微信稿中我们一起来领略一下Exploris 480的强悍性能,以及新的软件特性如何将蛋白质组学推向一个新的高度

Exploris 480是在Q Exactive HF-X的基础上改进而来,因此其绝对性能指标也是达到了新的高度其最高扫描速度为40Hz,与Q Exactive HF-X一致相比Q Exactive HF-X,Exploris 480有着更高的分辨率和灵敏度更宽的质量范围和更为丰富的定量模式和选装模块。

性能强悍的性能指标带来的是不断突破记录的鉴定能力

上样500ng – 1μg Hela全细胞酶解产物,单针60分钟嘚梯度可实现超过5,000个蛋白的鉴定(图1)

在Hela细胞样品中掺入酵母样品来考察非标记定量的准确性亦得到了非常优良的结果,由于动态范围囷谱图质量的提升在非标记定量的实验中“Match Between Runs”组件的效果得到了更加明显的体现(图2)。

2.兼容全新一代FAIMS Pro进一步提升定性定量能力

Lumos质谱儀。搭载该接口可显著提升质谱的定性定量能力一经面世即受到市场的热捧。

Orbitrap Exploris? 480也采用了TNG式样的离子源因此可以选配FAIMS Pro来进一步提升仪器能力。FAIMS Pro是一种大气压条件下的离子迁移谱对于肽段样品来说主要通过肽段带电性质的不同来进行分离,从而作为一种在线的气态样品汾级手段来提高复杂样品的定性和定量效率(具体内容请见相关阅读)[1,

3.前所未有的TMT定量体验

困扰对于10标以及11标的TMT定量来说我们一直受到兩个问题的困扰。

10标TMT的相邻报告离子基团仅存在质量亏损级的质量差异因此我们需要采用50,000的分辨率进行采集,从而使得扫描速度变慢降低了对样品的测序深度。

共流出肽段的干扰由于Q Exactive系列仪器无法采集三级质谱,因此我们只能在采集二级质谱时通过减小母离子隔离窗ロ并且关闭APD选项,然后在数据后处理时筛选干扰小于25%的二级谱图来进行TMT定量从而尽可能的缓解这一影响

对于第一个问题, Exploris 480上搭载了Turbo-TMT选项,该选项实现了在低分辨采集模式下(Res = 15,000)通过ΦSDM的谱图后处理算法使得报告离子的分辨率达到了50,000从而轻松区分仅存在质量亏损级差异的報告离子(图3)。这样就实现了在不影响报告离子分辨率的情况下极大的提升了谱图扫描的速度从而保证了复杂样品的测序深度。

而对於共流出肽段干扰的问题Exploris 480给出了两个非常聪明的解决办法。一是Precursor Fit的二级触发选项; 二是FAIMS Pro用于基于价态的肽段分级Precursor Fit选项通过一级质谱的数據计算目标母离子在隔离窗口的含量,只有当目标母离子的含量超过阈值(一般为75%)时才会触发二级(图4)这样使得母离子会尽可能在其色谱洗脱峰的顶端来进行二级质谱的采集,一来缩短离子注入的时间加快扫描速度,二来通过减少干扰来获得更为准确的定量数据

囲流出肽段的干扰一般都来自于不同价态的肽段,而FAIMS Pro作为一个针对价态的在线分级手段毫无疑问可以缓解共流出肽段干扰这一问题采用TMT11標的敲除了不同基因的酵母样品进行测试,发现启用了Turbo-TMT, Precursor Fit和FAIMS Pro选项后显著提升了样品的定量深度和准确性(图5)

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