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即送15丁当
【交流】R软件的meta分析操作&[精华]
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这个帖子发布于6年零225天前，其中的信息可能已发生改变或有所发展。
小弟不才，目前正在学习R软件，以下的介绍只是我的一点经验而已，如果有不对的地方请各位前辈指正！非常感谢！软件下载请参照zenmindlei前辈的帖子。/bbs/topic/?tpg=1&age=01.如何安装meta分析模块工具菜单中“程序包”—& “安装程序包”，会出现下载数据源的镜像列表，然后选择离自己距离最近的镜像，我自己选的是 China(Beijing 1)。如下图
不知道邀请谁？试试他们
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bv1013 edited on
然后会出现程序包列表，此时向下拖动列表，找到“meta”模块，点确定，然后等待安装完毕。如下图
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2. 如何加载meta分析模块工具菜单“程序包”—&加载程序包，首先请先选择“grid”，点确定，然后再操作一遍，“程序包”—&加载程序包，然后选择“meta”，点确定。至此，meta分析模块加载完毕。如下图
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yiyuexiong edited on
3.如何录入及保存数据3.1 创建数据框此时开始就需要命令操作了。在命令窗口中输入TmpData1 &- data.frame(name=c(&high&,&moderate&))，然后回车。 （注：TmpData1为数据框名字，name为变量名，high，moderate为临时变量）。如下图
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3.2 录入数据工具菜单“编辑”—&“数据编辑器”，然后出现对话框。填入你刚刚创建的数据框名字。如下图
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yiyuexiong edited on
点确定后，会出现传统的数据录入列表。从下图看出，刚刚我创建的name变量名，临时变量high，moderate都在里面。数据编辑器与STATA软件的数据编辑器一样，都可以随时改变变量名及数据。
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此时需要注意的是，在R软件中的变量分数字型（numeric）及字符型（character），我个人的操作是研究者名字用字符型，相关数据用数字型。如下图
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录入完整数据后的图示，如下图。输入完数据后，直接点击关闭（窗口右上角的X），不用担心数据丢失。
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3.3 保存数据工具菜单“文件”—&“保存工作空间”，然后把你的数据保存到你所需要保存的地方。如下图。
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4. 对连续性变量绘制森林图及漏斗图4.1 对连续性变量绘制森林图4.1.1 建立数据集在命令窗口中，输入TmpMeta1 &- metacont(Total1,Mean1,SD1,Total2,Mean2,SD2,studlab=Study,data=TmpData1,sm=&MD&,comb.random=TRUE,comb.fixed=FALSE,label.e=&Treatment&,label.c=&Control&)然后回车。（注：TmpMeta1为数据集名字；Total1，Mean1，SD1为治疗组的n，mean，SD，Total2，Mean2，SD2为对照组的n，mean，SD；studlab=Study为数据对应研究者的标签，data=TmpData中TmpData为你所建立数据框的名字，sm=&MD&为数据分析方法，我现在采用的是MD（Mean Differece），comb.random及comb.fixed为数据分析模型，也就是随机模型和固定模型，如果只想采用其中一种，那么请把所需要的模型设为TRUE，另外一种设为FALSE，如果两种都想采用，请不填入这两项（目前我的经验觉得这两项默认的就为TRUE）或者把这两项都设为TRUE，需要注意的是TRUE或者FALSE都为大写，因为R软件对于字母的大小写是敏感的；label.e及label.c为治疗组及对照组的标签，这个可以随着你的需要来更改。）
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yiyuexiong edited on
4.1.2 创建森林图在创建完数据集后，在命令窗口中填入forest(TmpMeta1),回车后就可出现所需要的森林图。如下图。
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yiyuexiong edited on
因为森林图里面没有数据合并后的P值等相关数据，要了解这样的数据，请在命令窗口中填入summary(TmpMeta1),即可出现相关数据。如下图。
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4.2 创建漏斗图在命令窗口中填入funnel(TmpMeta1),回车后即可出现所需要的漏斗图。如下图
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yiyuexiong edited on
4.3 检验漏斗图的发表偏倚在命令窗口中，输入metabias(TmpMeta1,method=&linreg&),回车后即可出现相关信息。（注：method=&linreg&的意思是采用Egger's test检验）如下图
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yiyuexiong edited on
相关操作说明在以下附件。
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以上介绍是我的一点经验，方法比较笨，或许有不对的地方，请各位前辈指正。R软件结果的检验大家可以与STATA的分析结果进行对比。目前连续变量的Meta分析已介绍完毕。谢谢大家！
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yiyuexiong edited on
丁香园准中级站友
学习了，获益匪浅。
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丁香园准中级站友
yiyuexiong 然后会出现程序包列表，此时向下拖动列表，找到“meta”模块，点确定，然后等待安装完毕。如下图注意：如果使用的是Win7系统，要先以管理员权限运行R软件，才能安装meta模块。
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丁香园准中级站友
yiyuexiong 2. 如何加载meta分析模块工具菜单“程序包”—&加载程序包，首先请先选择“grid”，点确定，然后再操作一遍，“程序包”—&加载程序包，然后选择“meta”，点确定。至此，meta分析模块加载完毕。如下图请问，grid是什么？为什么要先选择grid？
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丁香园准中级站友
R软件可以导入Stata或Excel的数据吗？请问，怎么导入？
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丁香园荣誉版主
zenmindlei 请问，grid是什么？为什么要先选择grid？不需要，安装META扩展包时就自动安装GRID扩展包。不过老版本的META扩展包，可能要先安装它。以前老版本的做出图不好看，好久不用它了，前几个月用新版本的作出的图也很漂亮。
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丁香园荣誉版主
zenmindlei R软件可以导入Stata或Excel的数据吗？请问，怎么导入？
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zenmindlei 请问，grid是什么？为什么要先选择grid？grid原来的意思是网格的意思，我这样介绍是因为我每次加载meta模块的时候系统都提示先加载grid模块，后来看到zhangdog版主的介绍，豁然开朗，谢谢zhangdog前辈的解释。
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分类资料的meta分析用R软件怎么做啊？
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楼主，为什么我下载了R软件后安装meta模块时出现错误呢？我点击工具菜单中“程序包”—& “安装程序包”，没有出现下载数据源的镜像列表，反而出现下图的提示，点取消后又提示R软件出现错误。这个到底是怎么回事？希望前辈指教
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丁香园准中级站友
yiyuexiong 4. 对连续性变量绘制森林图及漏斗图4.1 对连续性变量绘制森林图4.1.1 建立数据集在命令窗口中，输入TmpMeta1 &- metacont(Total1,Mean1,SD1,Total2,Mean2,SD2,studlab=Study,data=TmpData,sm=&MD&,comb.random=TRUE,comb.fixed=FALSE,label.e=&Treatment&,label.c=&Control&)然后回车。你好，我刚学这个软件，按照你的步骤进行，当进入到这一步的时候，怎么发现错误了！ 我不知道那里出错了！ 还请指正，O(∩_∩)O~
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很好，很强大
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丁香园准中级站友
命令操作下载meta包，加载meta包install.packages(&meta&)library(&meta&)
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丁香园准中级站友
创建数据和输入数据meta1=data.frame()fix(meta1)
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丁香园准中级站友
zhuzhongfen 分类资料的meta分析用R软件怎么做啊？见R软件和Stata的Meta分析功能比较
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丁香园准中级站友
qiang897 你好，我刚学这个软件，按照你的步骤进行，当进入到这一步的时候，怎么发现错误了！ 我不知道那里出错了！ 还请指正，O(∩_∩)O~你只下载了meta包，没有加载meta包。
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zenmindlei 命令操作下载meta包，加载meta包install.packages(&meta&)library(&meta&)zenmindlei 前辈你好，我已经按照你的命令输入了还是出现上面的错误。到底是怎么回事？
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zenmindlei 前辈到底是怎么回事，小弟很急啊。小弟重新下载了个R软件还是没法下载与加载meta包啊？是否跟小弟的网络有关
小弟是校园网
希望前辈指点
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丁香园荣誉版主
zhuzhongfen zenmindlei 前辈到底是怎么回事，小弟很急啊。小弟重新下载了个R软件还是没法下载与加载meta包啊？是否跟小弟的网络有关
小弟是校园网
希望前辈指点换个时间试试看，应该是网络的问题。不过你也可以从R网站将扩展包下载后，再通过“程序包”下拉菜单中的“从本地zip文件安装程序包”。
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zhuzhongfen zenmindlei 前辈到底是怎么回事，小弟很急啊。小弟重新下载了个R软件还是没法下载与加载meta包啊？是否跟小弟的网络有关
小弟是校园网
希望前辈指点对，换个时间看看效果怎样，一般晚上速度会好一点的。
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关于丁香园关注今日：2 | 主题：149637
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即送15丁当
【求助】R软件 单个率的meta分析遇到的问题
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这个帖子发布于2年零14天前，其中的信息可能已发生改变或有所发展。
本人因需要进行单个率的meta分析，所以使用R软件进行分析平均有效率，软件已经下载并安装meta包和选择镜像，但当执行命令metarate&- metaprop(event,n,study,data=a,sm=&PLOGIT&,incr=0.5,allincr=FALSE,addincr=FALSE,comb.fixed=TRUE,comb.random=TRUE,title=&&,complab=&&,print.byvar=TRUE, warn=TRUE)时，却出现：误: 没有&metaprop&这个函数。请问是什么问题，怎么解决，着急等候您的指教。谢谢！
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,建议大家参考这篇文章，刚刚搜索到
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metaprop对应的软件包是否安装了？
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我也需要做单个率的mate分析，但是啥也不会啊，能否分享一下。
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需要加载meta程序
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关于丁香园meta分析（5）
1、编程软件
（1）Stata
Stata软件是基于C语言的一个功能强大而又小巧玲珑的统计分析软件，最初由美国计算机资源中心研制，现为stata公司的产品。
R软件是基于S语言的一种免费开放式的统计编程环境，由auckland 大学 Ross Ihaka 和Robert Gentlemen
&及其他志愿者开发，目前由R核心开发小组维护。
2、非编程软件
（1）、Review manager&
Review manager &（Revman）是国际Cochrane协作网制作和保存Cochrane系统评价的专用软件。Revman是由北欧Cochrane中心制作和更新，免费软件，除商业用途外均可免费下载使用。
（2）Comprehensive meta-analysis
Comprehensive meta-analysis（CMA）软件是由美国国家卫生研究院资助、由英国和美国meta分析领域内公认的一群专家制作并进行维护更新的一款专程设计meta分析软件。CMA是商业软件，需要付费使用，价格不菲。
&（3）&meta-analyst软件
&meta-analyst（MA）软件是一款基于微软网络框架，由美国国立研究资源中心和医疗保健和质量研究机构资助，开始基于DOS系统后更改为Windows系统的免费meta分析软件。
&（4）、Meta- Dis软件
Meta- Dis（MD）软件是一款基于B语言有西班牙卫生部门资金资助，于2004年推出的诊断试验专用Meta分析软件。
&（5）、MIX
MIX（&meta-analysis with interactive eXplanations）是一款基于Excel2000及以上版本的，采用VB语言编写的，运行于Windons系统的meta分析软件。需要购买序列号激活才可以使用。
（6）、Meta Win
&Meta Win软件是1997年推出的一款基于windowns95系统及以上的meta分析专用商业软件。可免费下载使用体验版。
&3，其他软件
文章摘自：曾宪涛，Joey.S.W.Kwong,田国祥，董圣杰，meta分析系列之二: meta分析的软件[J]，中国循证心血管医学杂志2012 年4月第 4 卷 第2 期,89-91.
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参考知识库
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排名：千里之外
转载：65篇
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道具: 彩虹炫, 涂鸦板, 雷达卡, 热点灯, 金钱卡下一级可获得
道具: 显身卡
购买后可立即获得
权限: 隐身
道具: 金钱卡, 彩虹炫, 雷达卡, 热点灯, 涂鸦板
我这里有一些数据，希望得到各位的帮助。我做的是单个率的meta分析，结局指标有3个，当我完成第一个指标的meta分析时，在读取第二个指标的数据后，我应该如何修改命令才可以得到第二个指标的森林图啊？还有敏感性分析为什么我做不出来呢？命令metainf为什么做不出敏感性分析呢
支持楼主：、
购买后，论坛将把您花费的资金全部奖励给楼主，以表示您对TA发好贴的支持
载入中......
please use mataprop http://artax.karlin.mff.cuni.cz/r-help/library/meta/html/metaprop.html
fisher163 发表于
please use mataprop http://artax.karlin.mff.cuni.cz/r-help/library/meta/html/metaprop.html我用了，你可以帮忙处理一下吗？拜谢
metarate &- metaprop(event,n, study,data=a,sm=&PLOGIT&,incr=0.5, allincr=FALSE,addincr=FALSE,comb.fixed=TRUE,comb.random=TRUE,title=&&,complab=&&, print.byvar=TRUE, warn=TRUE)
forest(metarate)
以上是我做第一个指标森林图的命令，第二个指标如何实现森林图啊
/ty冰点陽光 发表于
metaratepls refer to the help. i am sure you can make it.
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