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《洞窟物語》（日語：洞窟物語，英語：Cave Story）是於2004年發布的一款上的遊戲，由利用5年間的業餘時間開發而成。《洞窟物語》以其對技術的充分利用與遊戲的：）而著稱，且也是對作者年少時玩過的《》等經典風格遊戲的致敬之作。
在作者自行發行該遊戲後，《洞窟物語》在網絡上逐漸贏得眾人青睞，其扣人心弦的劇情與也為評論家所稱道。後來在2010年間，獨立遊戲開發商：）和天谷大輔並肩協作，將遊戲到了與平台；而《洞窟物語》的增強版《洞窟物語+》隨後於2011年11月登陸。Nicalis亦為遊戲重製版本，並於2011年11月以《洞窟物語3D》之名發布平台版本。
遊戲講述了失憶的主角的故事：他在浮空之島的一個洞窟中醒來，但卻發現自己失憶了；而經過探尋之後，他發現了狂妄的博士的計劃——操控島上的原住民「咪咪卡」一族為他而戰，進而以之徵服地面諸國。於是主角力圖打敗博士，劇情即如此展開。
《洞窟物語》中玩家可以控制角色移動、跳躍與射擊。畫面左上角的：）顯示了當前裝備武器的名稱、等級與現有生命值。圖中的黃色三角形物品可用於提高武器經驗值。
在遊戲中，玩家可憑依或操控主角的行動，並依靠跳躍、解謎與射擊敵人來推動遊戲進程；在收集到多種武器後，玩家還可隨時一鍵切換當前使用武器。
在打敗敵人後，敵人有時會掉出黃色三角狀物品，將其拾取即可提高武器。獲得一定的經驗值後武器就會升級，且最高可升至3級；但若角色受傷，武器的經驗值亦會有所下降，到一定程度時還會使武器降級。在遊戲場景中還分布着一些生命膠囊（用以提升最大生命值）及擴容寶箱（開啟後增大導彈最大攜帶量），且有許多（NPC），玩家有時就需與NPC或物品互動。
《洞窟物語》的故事發生在一座漂浮在空中的島上，島上的原住民是一種好似兔子的類人生物——咪咪卡。咪咪卡是一種和平友善的生物，但若吃下島上特有的「赤之花」之後，就會變得兇猛狂暴。另外，島上還有一件蘊藏巨大魔力的寶物——惡魔王冠。為了得到這件寶物，人們派出了一支殺手機器人軍隊來到這一島上，而在搜尋寶物的過程中，大部分來自地面的機器人士兵無差別地屠戮咪咪卡。在遊戲故事開始前不久，布斯特博士、坂本一家、「博士」與許多助手組成了科學考察團，來到這座島上進行研究，但最後卻陷入了孤立無援的境地。
庫特在一個洞窟內醒來，覺察到自己對如何來到此處一事一無所知。走出洞窟後，他發現自己身處咪咪卡的村落之中，而這個村落深受博士之害。其時博士的手下米莎莉和巴魯羅格正在追捕一個名叫坂本數的女孩，而由於數已被轉化為咪咪卡，博士的手下們不僅沒有抓到數，還因誤認而錯綁架了另一隻咪咪卡——多隆子。
在此之後，庫特在蛋之迴廊找到了數，當時她在那兒找到了飛龍之卵，若其孵出飛龍則她可借之逃出這個浮空島。在從蛋之迴廊脫險而歸後，數打算要救出她的哥哥數馬。但咪咪卡村落的領袖金卻抓住了數，要她為多隆子被綁架一事負責；為了多隆子的安全，金甚至打算用她向博士換回多隆子。無奈之下，失去自由的數向庫特求助，讓庫特替她從草叢區救出她的哥哥。
在庫特救出數馬後，布斯特博士突然出現，並告訴他們博士打算在咪咪卡身上使用赤之花，以組建一支軍隊，進而征服地面世界。為阻止這一計劃，布斯特博士將庫特送到砂區，請他搶在博士前頭找到赤之花並毀滅掉。庫特在砂區遇到了同樣失去記憶的女性機器人卡莉·芙蕾斯，以及米莎莉的母親——保管着赤之花種子的老邁女巫珍卡。珍卡將庫特稱作「來自地面的士兵」，並將之視為來島上屠戮咪咪卡的殺手機器人軍隊的一員。由於巴魯羅格得到了赤之花存儲倉庫的鑰匙，博士得以獲取赤之花，並以多隆子做試驗品，強迫她吃下一朵以觀其效。這時金出現了，並試圖阻止博士，但他尚未碰到博士就被殺害了；而匆匆趕到的庫特無力回天，只得眼睜睜看着博士帶着赤之花逃走，而自己則被迫殺死狂暴化的多隆子。
為了懲罰妨礙博士的庫特，米莎莉將庫特傳送到了浮空島深處的一個迷宮中。在探索迷宮時，庫特發現卡莉也身陷迷宮，於是他們便攜手謀求逃出迷宮。而在途中，巴魯羅格展現出了它熱心的一面，幫助他們移開了堵住迷宮出口的巨石。尋找出路的庫特一行遇到了浮空島的核心，這一核心是種魔力生物，為浮空島供給維持漂浮狀態所需的能量。於是庫特一行打敗了核心，但博士卻立即出現，在浮空島的漂浮狀態被破壞前就轉移了核心。之後洪水就會把室內灌滿，而為了拯救溺水的庫特，卡莉把自己的氧氣瓶拆下，接到了失去意識的庫特身上。當庫特醒來後，若滿足一定條件，玩家就可選擇拯救卡莉。
回到咪咪卡村落後，庫特發現博士已經抓走了所有的咪咪卡；於是庫特前去蛋之迴廊，並與數馬重逢。數馬正打算乘飛龍離開浮空島，並會讓庫特選擇是否與他同行，如果玩家同意，則遊戲到此為止——博士征服了地面世界，而庫特和數馬隱居山中。玩家也可以選擇繼續對抗博士，並致力於摧毀浮空島的核心，如此咪咪卡們也能恢復正常。
接着庫特從外壁一路向上攀爬，直至到達目的地——大農場，博士便在此處奴役咪咪卡為他種植赤之花。博士的手下抓住了庫特，並將暈厥的他關進數所在的牢房內，而後在庫特蘇醒前帶走了數。庫特閱讀了數離開前留下的信，知道了一切的經過：博士為了得到惡魔王冠，加入了坂本一家和布斯特博士所在的科考隊，並在遂願後立即背叛了他們。在信的最後，考慮到媽媽似乎已有對抗博士的計劃，數拜託庫特去找她的媽媽。如果早先救出了卡莉，玩家就可以找到一樣物品，以恢復卡莉的記憶。卡莉恢復記憶後，想起了以前的事情：玩家角色的真名叫庫特，且和卡莉都非當初屠戮咪咪卡的殺手機器人軍隊的一員；他們來到這個島上的真正目的是摧毀惡魔王冠，以防其巨大魔力為惡人所利用。庫特找到了數的母親坂本美玲，了解到她正研究如何到達博士所在的島嶼之頂，並正為之製造火箭。在幫她完成火箭後，庫特乘上火箭到達島嶼頂部，並穿越最後的洞穴，去對抗米莎莉和博士。此時博士已經提純了赤之花的精華，並將之濃縮於一塊晶體之中，而後借之在庫特摧毀其肉體後，使他的精神仍然存活，並佔據了浮空島的核心，與之合為一體，但最後仍被庫特摧毀。
核心毀滅後，失去其魔力支撐的島嶼開始墜向地面。這時若滿足一定條件，玩家就可進入——關押着惡魔王冠的製造者波羅斯的「聖域」。波羅斯是珍卡的弟弟，曾是一名強大的法師，但在被拷打之後陷入瘋狂之中。米莎莉強迫波羅斯製造了惡魔王冠，但她和巴魯羅格也因此受到詛咒，只得為王冠的持有者效勞。在卡莉的幫助下，庫特戰勝了波羅斯，從此消滅了使島嶼下墜的負面力量的根源，拯救了島上的居民；然而，波羅斯所在的封印之間卻逐漸崩潰。恰在此時，巴魯羅格突然出現，將孤立無援的庫特兩人解救出來。據它自述，米莎莉派它來救援庫特一行，以報答他們為她解除詛咒的恩德。最後，庫特、卡莉和巴魯羅格一同離開了浮空島，並平靜地生活下去。
天谷大輔在為期5年的開發中獨力編寫故事、設計畫面、譜寫音樂並編寫程序。
天谷大輔利用5年間的業餘時間開發了《洞窟物語》。他在大學時就啟動了這一項目，並在他找到的工作後仍未停歇。在開發剛起步時，他譜寫了遊戲的開始畫面，並編程實現角色的基本移動動作。而在設計完一些封閉場景之後，他逐漸萌生出以洞窟為的想法。另外，據天谷大輔所述，由於他沒有事先擬定完備的項目計劃，因而並未編寫製作專用的和數據管理工具，結果導致後期出現了問題。
在2011年度上，天谷大輔做了《洞窟物語的開發物語》（The Story of Cave Story）的項目分析報告，並在此間強調了「實用主義設計」在《洞窟物語》開發中起到的重要作用。天谷大輔的設計頗具「復古風格」，正與其對兒時玩過的經典遊戲相契合；另一方面說，這亦保證他能夠獨力繪製大量的圖片，而這在遊戲開發中是不可能的。
在設計主角庫特時，天谷大輔從的上汲取靈感，仿效其經典外形，將庫特設計得頭大身小，並覆以白色的皮膚與紅色的襯衫，使之與黑色的洞窟背景形成強烈對比，以突出主角的存在感。而出於同樣的考慮，其他角色也多設計為淺色皮膚，或身着白色衣裝。在遊戲的中，所有敵人都形如肥皂塊，這一外形設定後來則演化為巴魯羅格的；另外Beta版中還出現了角色「」，這一角色在水中的行動更為敏捷。Beta版中的許多元素在後來的版本遊戲中重新引入。
為讓玩家對各留下深刻印象，天谷大輔在每一場景時，也都為之設定了單一的設計主題，如「蛋之迴廊」場景的設計主題為「溫暖」，而「砂區」則是「乾燥難耐」。另外，遊戲並未設置天谷大輔所不喜歡的「教學關」，而是直接在第一關便給了玩家兩條通路，且其中一條路不通，玩家必須走另一條路並取得一樣物品後，才能回頭打通此路。這一設定的靈感取自的開場，起到了「讓玩家覺得好像他們靠自己解決了問題」的作用，這一思想也貫徹遊戲始終。
《洞窟物語》最早於平台上發布，後來陸續移植到、與、、、、平台，遊戲甚至還移植到了出品的上。Nicalis則開發了《洞窟物語》的WiiWare版本，並在此版中對原版做出了改進：人物重新，音樂也，並加入了額外的遊戲模式。這一移植版在日於美國發布，並於其後在日於歐洲發布。相較之下，Nicalis另外開發的DSi平台（北美和日本的發行日分別為日和日）雖然在畫面和音樂上無甚改進，但也加入了聖域攻擊模式。另外，凱特琳·肖（Caitlin Shaw）為《洞窟物語》重製了基於的——NxEngine，使遊戲得以擴展和修改，同時也讓《洞窟物語》能更為便利地移植到其他設備上。《洞窟物語》的版本則於日在上架，這一版本納入了DSiWare版本所含的「點唱機模式」，同時也包括了《洞窟物語+》中的所有附加遊戲模式。
Nicalis還為《洞窟物語》開發了加強版——《洞窟物語+》，不僅囊括了WiiWare平台版本的所有附加遊戲模式，而且允許玩家選擇畫面和音頻樣式：玩家可以從原版和WiiWare改進版中選擇喜歡的畫面風格，音樂也可以選擇原版、WiiWare移植版或3DS版；與此同時還提供了一個原創——「風之要塞」。這一版本於日在上發行，後於2012年4月發行到：），同時遊戲也成為了第四期的獎勵遊戲與第七期的收錄遊戲。
《洞窟物語3D》是遊戲的版本，由Nicalis主持開發，並由發行於任天堂3DS平台，遊戲在北美、歐洲和日本的發布時間分別為日、11月11日與日。與原版相比，這一版本使用重頭構建畫面，加入了視角自動調節系統和一個，並引入了：）製作的音軌，其日語版本還有NIS發行的其他遊戲（包括《：）》、《：）》與）的角色客串。為了有更多時間完善《洞窟物語3D》，天谷大輔甚至辭去了的工作，轉而擔任《洞窟物語3D》的總監。他曾談到，鑒於需要考慮多得多的細節問題，轉向的確較為困難。
《洞窟物語》在評論家中贏得了廣泛的讚譽：評述道：「從影響力和遊戲時間看，（《洞窟物語》的地位）如此之高，以至可與現今上的與一競高下」。美國電玩雜誌《》的馬特·米勒（Matt Miller）則洞察到《洞窟物語》雜糅了銀河戰士、、、與惡魔城的元素，並將其糅合成「引人入勝、富有挑戰性且有足夠長度」的整體。：）將遊戲的流行歸功於其「優雅的風格，吸引人的劇情及引人入勝的作畫」。另一美國電玩雜誌《》亦如是說：「蓬勃發展中的西方獨立遊戲界對這類日本先鋒實在虧欠太多，他（指天谷大輔）的熱門《洞窟物語》證明了若有足夠的想象力、技術和熱情，開發者獨自一人也能打造出一款富有深度而引人入勝的」。Destructoid的喬納森·福爾摩斯（Jonathan Holmes）稱其為一款「重要的遊戲」，他洞察到《洞窟物語》對獨立藝術遊戲（如《》）的影響，以及同後來2D遊戲（如的《》）設計的相關性，此外他還將遊戲的設計思想與不用教程就教會玩家的風格相比較，認為其恰如《》開頭的設置。2006年7月，《洞窟物語》在瑞典電玩雜誌《：）》的「史上50最佳免費遊戲排行榜」中登上榜首。
WiiWare版本亦廣受好評，對其批評意見則集中在免費提供多年後，突然標出1,200（折合12美元或10英鎊）的售價。的傑勒米·帕里什（Jeremy Parish）稱讚了該版本中的畫面改進，並稱其「毫無折損（遊戲）深受經典作品影響的魅力」；在玩家操作方面，他也認為，比起原版的，：）和的控制則好太多；而在價格問題上，他談到「這一傑作以富有詩意（的風格）打動了我，而在為之付出不懈的努力後，天谷（大輔）終於有望藉此小有所獲」，並認為這一作品「絕對物有所值」。的約翰·特提（John Teti）也抱持類似的意見，但也提到後的音樂存在技術性問題，並因此更推崇原版音軌。英國電玩雜誌《》則將這一重製版與《》相比較，認為重製畫面兩全其美，既以新畫面來契合現代品味，又提供切回原始畫面的選項以滿足經典遊戲愛好者。IGN的迪蒙·哈特菲爾德（Daemon Hatfield）認為《洞窟物語》「歸屬（應為）系統（指任天堂）」，並提到其與《：）》在遊戲模式上的相似之處，即對玩家角色的傷害也會降低武器威力這一點。除此之外，《洞窟物語》還被提名2010年度《》年度遊戲獎及WiiWare年度遊戲獎。
對《洞窟物語3D》的評價就像是對WiiWare版評價的回聲一樣。許多評論家認為畫面上的改進與其折合40美元的初始標價並不相稱，尤其是在當時已可通過下載服務獲取其更便宜（甚至免費）的版本的情況下。的帕里什則為這一版本辯護，談到《洞窟物語》在發行多年後，終於能以遊戲卡帶為載體發布，買下一份也是值得的。Destructoid的福爾摩斯稱讚了新版加入的視角自動調節系統與以重製的畫面，並將之與經典的電影相比較，認為這一版本是「遊戲的最佳版本，（但）不一定是最終版本」。的簡·道格拉斯（Jane Douglas）認為對於遊戲的控制方式來說，3DS的Circle Pad（擴充遊戲桿底座）用起來相當舒適，但也抱怨遊戲的3D效果使玩家更難看出平台所在，也難以區分前景和背景，IGN的奧德麗·德雷克（Audrey Drake）在評論中也談到了這一不足。英國《任天堂官方雜誌》（Official Nintendo Magazine）的西蒙·帕金（Simon Parkin）則更為尖銳地指出遊戲中3D模型細節缺失，且色調也過暗。而在日本電玩雜誌《》上，四個評論者分別為之打出了7、7、8、8分（滿分10分），總計30分，處於平均水平。這一遊戲還獲2011年《任天堂力量》最佳冒險遊戲獎提名。
Studio Pixel, Cave Story. PC, Studio Pixel. , "原文：Jenka: Concerned, the Mimigas finally ingested the forbidden red flowers, and in their murderous rage began to strike back against the robots. 中譯：珍卡：憂慮之下，咪咪卡最終開始攝取禁忌的赤之花，然後兇猛狂暴地反擊機器人。"
Studio Pixel, Cave Story. PC, Studio Pixel. , "原文：Curly Brace: Back then, a huge number of robots were sent to this island from countries on the Earth's surface. Their target was the awesome power kept within this island... The Demon Crown.中譯：卡莉·芙蕾斯：從前，大量的機器人被從地面上的國家送到這個島上。它們的目標是這個島上蘊藏的巨大力量……惡魔王冠。"
Studio Pixel, Cave Story. PC, Studio Pixel. , "原文：Jenka: You're a soldier from the surface, aren't you. ..... It wasn't long ago that hundreds of robots like you came to this island. Countless Mimigas perished at their hands.中譯：珍卡：你是來自地面的士兵，不是嗎。……不久前就有如你一樣的上百號機器人來到這個島上。無數的咪咪卡就在它們手上喪命。"
Studio Pixel, Cave Story. PC, Studio Pixel. , "原文：Sue's letter: We came to this island from the surface on a research trip. Prof. Booster was on our helicopter, and so was my mother, my brother, various assistants... The Doctor as well. [...] Once he had the Crown in his possession, no one could stand up to him. We had no choice except to continue our research of the island under his orders.中譯：數的信：我們從地面來到這個島上進行調查。（當時）布斯特博士就在我們的直升機上，還有我的媽媽、哥哥以及許多助手……還有博士。……當他掌控了（惡魔）王冠之後，就無人可以悖逆他了。我們沒有其他選擇，只能聽從他的號令，繼續對這個島進行研究。"
Studio Pixel, Cave Story. PC, Studio Pixel. , "Sue: This egg could be our ticket off this island!中譯：數：這個蛋可以成為離開這座島的保證！"
Studio Pixel, Cave Story. PC, Studio Pixel. , "原文：Balrog: You win... I'll move the rock for you. But remember... Don't tell ANYONE that I helped you.中譯：巴魯羅格：你贏了……我會幫你移開這塊石頭，不過記得……別告訴任何人我幫了你的忙。"
Studio Pixel, Cave Story. PC, Studio Pixel. , "原文：Misery: This is the heart of the island! If you stop it, the island will fall to the earth! / ... / Doctor: Bring the core to the laboratory at once!中譯：米莎莉：這是這座島的心臟！如果你讓它停止運轉，這座島就會墜落到地面上！……博士：馬上把核心轉移到實驗室去！"
Studio Pixel, Cave Story. PC, Studio Pixel. , "原文：Narrator: And so was your escape from the island successful. Before long, the Doctor began his attack on the earth, using the floating island as a base... [Y]ou and Kazuma quietly lived out the rest of your days...中譯：旁白：於是你成功地逃出了這座島。沒過多久，博士開始進攻地面，並以浮空島為基地……你和數馬則靜靜地度過餘生。"
Studio Pixel, Cave Story. PC, Studio Pixel. , "原文：Sue's Letter: The Doctor knew this even before coming to the island, which is why he wormed his way into our group in the first place. Once he had the Crown in his possession, no one could stand up to him... Help my mother. The password is "Litagano Motscoud".中譯：數的信：博士在來到島上之前就知道這件事（即惡魔王冠的存在）了，這就是他加入考察隊的根本原因。當他把惡魔王冠收入囊中之後，就無人可以抵抗他了……請幫助我的媽媽。口令是「Litagano Motscoud」。"
Studio Pixel, Cave Story. PC, Studio Pixel. , "原文：Curly Brace: Your name's Quote! ... The two of us were sent in order to destroy [the Crown].中譯：卡莉·芙蕾斯：你的名字是庫特！……我們倆為了摧毀（王冠）而來到這兒。"
Studio Pixel, Cave Story. PC, Studio Pixel. , "原文：Doctor: The power of the Red Crystal is wondrous indeed... My body may be wrecked, but my consciousness has never been more distinct.中譯：博士：赤之結晶的力量的確驚人啊……我的肉體已然毀滅，但我的意識卻未曾如此清醒。"
Studio Pixel, Cave Story. PC, Studio Pixel. , "原文：Narrator: It was Jenka's daughter Misery who made Ballos create the Demon Crown. She was subsequently cursed by the crown, forced to do the bidding of all who wear it.中譯：旁白：珍卡的女兒米莎莉讓波羅斯製造了惡魔王冠，而她隨後就被王冠詛咒，被迫聽命於所有佩戴王冠的人。"
Studio Pixel, Cave Story. PC, Studio Pixel. , "原文：Balrog: You beat Ballos, right? When you did that, it lifted our curse. / ... / Curly Brace: Our mission is over, and now I just want to live out my days somewhere where I can relax and enjoy a beautiful view... / Balrog: ...would it be all right if I joined you there?中譯：巴魯羅格： 你打敗了波羅斯，對吧？在你成功後，我們所受的詛咒就解除了。……卡莉·芙蕾斯：我們的任務完成了，現在我只想找個能讓我放鬆並享受生活的地方度日……/巴魯羅格：……可以讓我加入你們嗎？"
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：隱藏分類：洞窟物语外传卡莉篇-钢铁的羁绊_百度百科
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游戏内容是“在厨二妄想力全看开下，卡莉视点的洞窟物语”。 玩家对象主要是能够自在操控推进器的玩家、 或者是能够在本编中3分钟内通过圣域的玩家。 （虽然在本作中基本上不会使用推进器，主要是指达到那种程度的操作等级） 不过，如果只是BAD END为止的关卡基本上最多也只是圣域等级，相信也能够令各位玩的愉快。此版本是原作《洞窟物语》优秀mod之一，剧情建立在原版之上，通过卡莉的视角完美的衔接了原版剧情，使洞窟物语的剧情更加完善。其他优秀mod：CaveStory - Quote the Mimga Mode，Corridor_X，Jenka's Nightmare，以上mod及本mod与原版收录于《洞窟物语5版本珍藏集》游戏类型动作冒险界面语言中文
玩家卡莉在一个洞窟中醒来，发现旁边倒着一个机器人，却什么也想不起来。她走出洞穴，发现来到了咪咪卡的村庄。这座村庄受到了杀人机器的迫害。杀人机器正在追杀一只咪咪卡——科隆妮。最终，科隆妮被抓走。
卡莉为了寻找科隆妮，通过亚瑟家的传送器来到了蛋之回廊。她在那儿帮助了一只想要变强的咪咪卡——伊格尔，找到了杀人机器，却还是不知道科隆妮的行踪。此时，住在草丛区的咪咪卡恰可告诉村庄的NO.2——金，说看到了杀人机器和科隆妮。金知道后马上赶了过去，随后卡莉也赶到了草丛区。
在草丛区，卡莉发现金被关在一间屋子里，并得知科隆妮服用了赤之花，而她的孩子游戏封面则在橡胶仓库。卡莉到达橡胶仓库后，杀人机器和服用了赤之花的科隆妮突然出现。卡莉十分无奈，只好杀死了科隆妮和杀人机器。当她想要拯救科隆妮的孩子们时，无意间触发了陷阱，失去了记忆。随后赶来的金将卡莉带回了咪咪卡村，并告诉她沙区有位魔女，可能有办法回复卡莉的记忆。
卡莉为了恢复记忆，来到了沙区。可沙区的魔女——珍卡，由于害怕卡莉以前是个杀人机器，不肯帮助她，只让她与科隆妮的孩子——科恩们住在沙区收容所。就这样，日子一天天过去了。一天，卡莉照常去工作，得知了出现了博士的消息。当卡莉回到沙区后，发现后面的一个机器人——库特走来。卡莉以为是杀人机器，匆匆回到了沙区收容所，却还是被库特打败。后来，卡莉得知他并不是杀人机器的消息，就将他当成了伙伴。后来，卡莉来到沙区的仓库，发现金和库特跑了进去。当卡莉想进去时，却被博士的手下——米莎莉和巴鲁罗格拦住，被传送到了迷宫。
迷宫的下吕医生与莲美护士发现卡莉倒在路上，就开始照顾起受伤的卡莉。一天，库特来到这儿，并帮助卡莉拿来了万能药。卡莉恢复后，立刻与出发。
寻找出路的卡莉一行遇到了浮空岛的核心，这一核心是种魔力生物，为浮空岛供给维持漂浮状态所需的能量。卡莉一行打败了核心，但博士却立即出现，在浮空岛的漂浮状态被破坏前就转移了核心。之后洪水把室内灌满，而为了拯救溺水的库特，卡莉把自己的氧气瓶拆下，接到了失去意识的库特身上。
随后，被库特背着的卡莉从大动脉飘到了水路里，看到了克隆的米沙莉，随后飘到了大农场。
在大农场，克苏鲁救了卡莉，可卡莉却再次失去记忆。库特为了帮助卡莉，拿来了可以恢复记忆的蘑菇。卡莉恢复了记忆后，继续开始了消灭博士的旅程。可是前往博士所在地的火箭却坏了。这时候，布斯特博士突然出现，修好了火箭。卡莉乘着火箭飞了上去，来到最后的洞穴里，却发现出口被堵住。卡莉找到了另一个出口，来到了外壁里，打败了克隆米莎莉，以及将自己的灵魂转移到核心身上的前任王冠持有者，而自己却飘服到了圣域，昏迷了。·蛋之回廊的护卫机器人换成了别的角色。
·从水路到记忆回复之间增加了关卡，并且埋下了TRUE END的伏笔。
·记忆回复后，遇到布斯特博士前都无法前往大农场之外。
·NORMAL END的剧情改为从外壁落下后的发展。
·复仇女神的相关事件的改动。
·克隆米沙莉战后可以保存了。
·增加了奖励模式，可以用LV1武器对最终BOSS进行TIME ATTACK。这个状态是本来预定在正编中最终战时采用的
·修正了在简便小屋打到BOSS的时候能量水晶从奇怪的地方出现的问题
·修正了在空中调查火箭时火箭会掉下来的问题
·修正了从蛋之回廊？回到亚瑟的家或者前往监视室会出现错误的问题
·修正了在最终BOSS前从迷你核心下面绕过去触发事件时会发生的错误。
·修正了结局时库特装备着无常之星的问题。Minimum:
OS:Windows XP
Processor:Intel Core Solo
Memory:128 MB RAM
Graphics:64MB RAM
Hard Drive:64 MB HD space
Recommended:
OS:Windows 7
Processor:Intel Core Duo 2.0 Ghz and above
Memory:512 MB RAM
Graphics:256MB RAM, non-integrated
Hard Drive:64 MB HD spacez是跳跃，x是射击。w是查看地图，方向键下是进入房间开箱子对话等。Q是道具画面，A/S是切换武器（默认情况下，可更改）O是跳跃，X是射击。△是查看地图，下是进入房间开箱子对话等。□是道具画面，L/R是切换武器。（默认操作，可更改）[1]
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